Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms