Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms