Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms