Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms