Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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