Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms