Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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