Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP74Q9C0B2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP74Q9C0B2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms