Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM31Q9BZY9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM31Q9BZY9 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms