Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCO2Q9BYV7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms