Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms