Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms