Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms