Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms