Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms