Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms