Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms