Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO3Q8TAP4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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