Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms