Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE22Q8NFJ8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms