Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID1BQ8NFD5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms