Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms