Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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