Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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ZNF550Q7Z398 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ZNF550Q7Z398 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF550Q7Z398 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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