Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDXQ7Z353 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms