Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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