Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4orf50Q6ZRC1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf50Q6ZRC1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms