Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms