Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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