Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms