Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRT3Q5FWE3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRT3Q5FWE3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms