Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms