Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LINC02069-201ENST00000457449 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KLF17-201ENST00000372299 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms