Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms