Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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