Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms