Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms