Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms