Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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