Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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