Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GRIK5Q16478 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GRIK5Q16478 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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GRIK5Q16478 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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GRIK5Q16478 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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GRIK5Q16478 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GRIK5Q16478 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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