Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC1Q15915 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC1Q15915 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC1Q15915 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC1Q15915 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ZIC1Q15915 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC1Q15915 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC1Q15915 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 286.6 ms