Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms