Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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SYCP1Q15431 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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