Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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PUM3Q15397 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PUM3Q15397 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PUM3Q15397 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PUM3Q15397 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PUM3Q15397 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PUM3Q15397 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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