Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms