Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms