Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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CHD4Q14839 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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CHD4Q14839 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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CHD4Q14839 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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CHD4Q14839 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHD4Q14839 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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