Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SMC1AQ14683 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SMC1AQ14683 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SMC1AQ14683 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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