Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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